Edward Elric et son petit frère Alphonse vivent dans un monde dans lequel l'alchimie est pratiqué par de nombreuses personnes et respectée en tant que sciences.

Les deux frères tentèrent grâce à cette science de ressuciter leur mère, mais l'achimie n'étant pas si simple, Alphonse y perd son corps et Edward sa jambe, puis en scellant l'âme de son frère dans une armure afin que ce dernier échappe à la mort, il perd son bras droit. Ses deux membres seront remplacés par des membres métallique.

Les deux frères n'ont plus alors qu'un seul butte : trouver la pierre philosophale qui leurs corps initiales. Pour cela Edward décide de devenir un alchemist d'état.